Подскажите по настройке сервера. Падает скрипт

Добавте пару(восемь) гигов в SWAP и поидее збс будет. 

Я имел ввиду не настройки, а статистику блокировок.

SHOW STATUS LIKE 'Table%'

и там будет Table_locks_immediate , Table_locks_waited и т.д.
Можно сбросить счетчик для чистоты эксперимента.

Да и кстати попробуйте ради эксперимента в innoDB конвертнуться - это же довольно быстро.
Кстати2, вы же не пишете в ту же таблицу, по которой проходите? Или, по крайней мере, сначала собираете все записи в массив?

А давайте вы задание у сисадминов оформите,  я вам настрою?

inter-job, спасибо, посмотрю.
Цитата (inter-job):

вы же не пишете в ту же таблицу, по которой проходите?

Нет, не пишу. Я делаю 1 запрос к БД, он возвращает 20 тыс записей, прогоняю результат через foreach, в котором делаю еще разные запросы к другим таблицам (в том числе и суммарные выборки за месяц, довольно много данных обрабатывается).

DimaShpak, благодарю за предложение, но интересно разобраться самому