Партнерская программа + простой инет-магазин

Можно использовать готовые скрипты, просто в этом случае необходима настройка.

Магазин должен содержать возможность выписки счетов, отслеживание выполнения заказа пользователем, расчет почтовых затрат на пересылку, возможность определения "лидера продаж", что чаще всего заказывают с этим товаром (или рекомендуемые товары), ну и все основные функции магазина.

Партнерка. Возможность оплачивать за клики и за продажи (даже через пару месяцев), возможность для партнера отследить состояние выполнения заказа, заявка на ручной вывод средств. Для админа надо: активность партнеров, возможность бана, установка привелегий и т.д.