Проверить аккаунт хостинга на наличие вредоностных файлов или программ

Виртуальный хостинг у одного из крупных российских хостеров.  За последние два месяца уже два раза в аккаунте по сообщениям хостинга были обнаружены вредоносные файлы. Один раз скриптом были переписаны все файлы с index в названии. 

Доступ к аккаунту ограничен всего двумя сотрудниками. Нужно разобраться, откуда в аккаунт попадают вредные файлы и предпринять меры, чтобы этого не повторялось. 

Сайтов на аккаунте всего 3, и все очень простые. 

Оплата яндекс-деньги или Paypal. Перевод на карту - только постоплата.