Выявить причину 504 ошибки на сервере

1. atop: параметр vmcom 5.1G. Когда он меньше 9Гб, то все работает как надо

Как только параметр vmcomстановится более 9Гб то сервер начинает страшно тормозить.

Нужно выявить причину ошибки 504 сервера

Мы выставили такие параметры

вначале сервер летал, но к концу дня стала постоянно вылетать ошибка 504

wait_timeout 20800

interactive_timeout 20800

query_cache_size 256M

join_buffer_size 2M

tmp_table_size 256M

max_heap_table_size 32M

thread_cache_size 4

table_open_cache 4

innodb_buffer_pool_size 3G

До этого параметры были такими (все работало, но не очень быстро)

max_connections 200

wait_timeout 28800

interactive_timeout 28800

query_cache_size 128M

join_buffer_size 1M

tmp_table_size 128M

max_heap_table_size 16M

thread_cache_size 4

table_open_cache 4

innodb_buffer_pool_size 1.5G

Конфиг сервера приблизительно такой https://www.hetzner.de//en/hosting/produkte_rootserver/ex60