Оптимизировать сервер на Debian 8

Имеется сервер под управлением Debian 8 Jessie 64 bit и конфигурацией: Intel® Xeon®, E5-1650 v3 Hexa-Core Haswell - 6 ядер, 256 GB ECC RAM (If a server has been ordered before 27.04.2016 it has 128Gb RAM), 2 x 4 TB 6 Gb/s SATA 7200 rpm Software-RAID 1. 

На этом сервере размещено большое количество файлов. Эти файлы активно загружаются. На данный момент скорость загрузки очень низкая, включая и то что попасть через FTP под root на сервер нельзя, чтобы добавить туда новые файлы.

Задача:

1. Сделать все возможное чтобы увеличить скорость работы сервера, доступ к серверу через FTP.

2. Отключить все ненужные функции. 

3. Добавить возможность регулировать скорость отдачи файлов пользователям, при большом их количестве.

4. Защита сервера от автоматического парсинга файлов.