Скрипт дизайна праймеров для ПЦР
Разместите заказ на фриланс-бирже и предложения поступят уже через несколько минут.
http://php-programmist.ru/portfolio/php-scripts/primer-designer.html
Для Луганской Диагностической Лаборатории (ЛДЛ) был разработан скрипт для дизайна праймеров ПЦР. Праймеры - это олигонуклеотиды, необходимые для "затравки" реакции полимеризации. С помощью пары праймеров исследователь может выделить нужный участок ДНК.
Для того, чтобы подобрать нужные праймеры, нужно учесть множество факторов - таких как:
- Длина
- Температура отжига
- Температура плавления
- Процентное содержание Гуанина и Цитозина
- Специфичность праймеров
и др.
Мой скрипт призван помочь дизайнеру праймеров, показывая ему некоторые из перечисленных параметров. При дизайне праймеров руководствуются такими правилами:
- Длина праймера должна составлять от 15 до 25 пар нуклеотидов.
- Процентное содержание Гуанина-Цитозина должно колебаться от 50% до 60%.
- Температура плавления варьирует в пределах 52-60 °С.
-Температура отжига обоих праймеров должна отличаться максимум на 3°С.
При достижении оптимальных показателей, они высвечиваются зелёным цветом. В поля праймеров можно ввести только буквенные обозначения дезокси-рибонуклеотидов: G, C, T, A.
