Скрипт дизайна праймеров для ПЦР

Веб-программирование
731 просмотр
20.06.2011
945×24127 КБ
Скрипт дизайна праймеров для ПЦР.png

http://php-programmist.ru/portfolio/php-scripts/primer-designer.html Для Луганской Диагностической Лаборатории (ЛДЛ) был разработан скрипт для дизайна праймеров ПЦР. Праймеры - это олигонуклеотиды, необходимые для "затравки" реакции полимеризации. С помощью пары праймеров исследователь может выделить нужный участок ДНК. Для того, чтобы подобрать нужные праймеры, нужно учесть множество факторов - таких как: - Длина - Температура отжига - Температура плавления - Процентное содержание Гуанина и Цитозина - Специфичность праймеров и др. Мой скрипт призван помочь дизайнеру праймеров, показывая ему некоторые из перечисленных параметров. При дизайне праймеров руководствуются такими правилами: - Длина праймера должна составлять от 15 до 25 пар нуклеотидов. - Процентное содержание Гуанина-Цитозина должно колебаться от 50% до 60%. - Температура плавления варьирует в пределах 52-60 °С. -Температура отжига обоих праймеров должна отличаться максимум на 3°С. При достижении оптимальных показателей, они высвечиваются зелёным цветом. В поля праймеров можно ввести только буквенные обозначения дезокси-рибонуклеотидов: G, C, T, A.
PHP