Натянуть вёрстку на движок

Есть движок самописный у меня со стандартным шаблоном, есть другой сайт на таком же движке, но с другим шаблоном, я выкачал другой шаблон с сайта и залил поверх текущего шаблона, новый дизайн отображается корректно, так как структура сайтов одинаковая. Но отображается выкачанный дизайн только через выкачанный index.html. Через index.php отображается старый дизайн, а нужно что бы через index.php отображался новый. Мне помогли вчера сделать что бы через index.php отображался дизайн, просто в него вставили подгрузку css в index.php, но я проверил там авторизация и регистрация не работала, это не помогло и я вернул как было, видимо нужно связать ещё некоторые файлы. 

Если правильно мне подсказали, то нужно перенатягивать шаблон, с расстановкой переменных.